Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms