Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Q3U595 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Q3U595 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Q3U595 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Q3U595 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Q3U595 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms