Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ssbp4Q3U4B1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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