Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Rnf149Q3U2C5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rnf149Q3U2C5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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