Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc38a5Q3U1J0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms