Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem35bQ3U0Y2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms