Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rufy4Q3TYX8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rufy4Q3TYX8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms