Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm21440Q3TTD8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm21440Q3TTD8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm21440Q3TTD8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm21440Q3TTD8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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