Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdpgp1Q3TLS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdpgp1Q3TLS3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms