Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cwc27Q3TKY6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cwc27Q3TKY6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms