Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fubp3Q3TIX6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms