Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Trappc13Q3TIR1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Trappc13Q3TIR1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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