Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sppl2bQ3TD49 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms