Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrp1aQ2LKU9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nlrp1aQ2LKU9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms