Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ptchd1Q14B62 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ptchd1Q14B62 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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