Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpusd2Q149F1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms