Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col19a1Q0VF58 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms