Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp2b3Q0VF55 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp2b3Q0VF55 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms