Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cntnap5cQ0V8T7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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