Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cnnm1Q0GA42 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms