Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Col9a2Q07643 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms