Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
AmbpQ07456 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms