Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms