Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox13Q04891 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms