Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sox12Q04890 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms