Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RelaQ04207 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms