Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms