Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnd1Q03719 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnd1Q03719 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms