Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gjb5Q02739 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gjb5Q02739 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms