Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snai1Q02085 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snai1Q02085 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms