Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Nme2Q01768 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Nme2Q01768 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms