Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mc1rQ01727 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mc1rQ01727 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms