Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EgfrQ01279 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EgfrQ01279 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms