Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gja5Q01231 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gja5Q01231 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms