Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms