Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpina1cQ00896 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpina1cQ00896 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms