Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gabpb1Q00420 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms