Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx2Q00262 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx2Q00262 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx2Q00262 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms