Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vps45P97390 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms