Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
H3f3aP84244 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
H3f3aP84244 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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