Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gabpb2P81069 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms