Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Irx2P81066 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms