Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptprn2P80560 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms