Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cct5P80316 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms