Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atp8a1P70704 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms