Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rad50P70388 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms