Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NfixP70257 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfixP70257 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NfixP70257 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NfixP70257 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NfixP70257 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NfixP70257 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NfixP70257 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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NfixP70257 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms