Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Plxna3P70208 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Plxna3P70208 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms