Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrig1P70193 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrig1P70193 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms