Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Traf5P70191 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms